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Institut de Chimie Organique et Analytique

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Identité

Institut de Chimie Organique et Analytique ( ICOA )
Institut de Chimie Organique et Analytique - ICOA UMR7311, Rue de Chartres, Orléans, France
Contact n°1: pascal.bonnet@univ-orleans.fr
Contact n°2: samia.aci-seche@univ-orleans.fr, stephane.bourg@cnrs.fr
Tutelles : Université d'Orléans - CNRS
Date de création : 1995
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Nature des prestations

Savoir faire : Conception et optimisation de molécules bioactives, criblage virtuel. Prédiction de constantes d'affinité, cinétiques et de propriétés ADME-Tox. Approches proteochimiométriques (chémogénomique) et Machine Learning.
Spécificités : Conception d'inhibiteurs de protéine kinase (PKI). Approche SBDD et FBDD à partir d'un outil innovant développé dans l'équipe (Frags2Drugs). Prédiction de la cinétique des processus d'association/dissociation des complexes récepteur/ligand (kon, koff, temps de résidence) à partir de simulations de dynamique moléculaire. Prédiction de propriétés ADME-Tox par des méthodes d'apprentissage machine et visualisation des contributions atomiques à ces propriétés via des cartes d'activité. Préparation de bases de données de molécules (VSPrep).
Domaine d'application : Drug Design, Hit identification, Hit to Lead, Lead Optimisation.
Tests proposés : Préparation de chimiothèques. Conception de nouveaux inhibiteurs de kinases à partir de fragments. Simulation des sorties de ligands et classification par temps de résidence. Prédiction de la selectivité des inhibiteurs de kinases par des approches protéo
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Ressources

Équipements : Un cluster de 6 nœuds de 12 cœurs à 2.67GHz + 1 nœud de 28 cœurs à 2.4 GHz ; un cluster de cartes GPU K20, K80 et GTX TitanZ
Ressources humaines : 3 permanents (Pr, CR, IE)
Technologies : Chémoinformatique, SBDD, FBDD, Développement d'outils in silico en langage python ; développement de modèles QSAR ; docking (amarrage moléculaire) ; simulations de dynamique moléculaire