Institut de Chimie Organique et Analytique

Institut de Chimie Organique et Analytique ( ICOA )

Institut de Chimie Organique et Analytique - ICOA UMR7311, Rue de Chartres, Orléans, France

Contact n°1: pascal.bonnet@univ-orleans.fr

Contact n°2: samia.aci-seche@univ-orleans.fr, stephane.bourg@cnrs.fr

Tutelles : Université d'Orléans - CNRS

Date de création : 1995

Savoir faire : Conception et optimisation de molécules bioactives, criblage virtuel. Prédiction de constantes d'affinité, cinétiques et de propriétés ADME-Tox. Approches proteochimiométriques (chémogénomique) et Machine Learning.

Spécificités : Conception d'inhibiteurs de protéine kinase (PKI). Approche SBDD et FBDD à partir d'un outil innovant développé dans l'équipe (Frags2Drugs). Prédiction de la cinétique des processus d'association/dissociation des complexes récepteur/ligand (kon, koff, temps de résidence) à partir de simulations de dynamique moléculaire. Prédiction de propriétés ADME-Tox par des méthodes d'apprentissage machine et visualisation des contributions atomiques à ces propriétés via des cartes d'activité. Préparation de bases de données de molécules (VSPrep).

Domaine d'application : Drug Design, Hit identification, Hit to Lead, Lead Optimisation.

Tests proposés : Préparation de chimiothèques. Conception de nouveaux inhibiteurs de kinases à partir de fragments. Simulation des sorties de ligands et classification par temps de résidence. Prédiction de la selectivité des inhibiteurs de kinases par des approches protéo

Équipements : Un cluster de 6 nœuds de 12 cœurs à 2.67GHz + 1 nœud de 28 cœurs à 2.4 GHz ; un cluster de cartes GPU K20, K80 et GTX TitanZ

Ressources humaines : 3 permanents (Pr, CR, IE)

Technologies : Chémoinformatique, SBDD, FBDD, Développement d'outils in silico en langage python ; développement de modèles QSAR ; docking (amarrage moléculaire) ; simulations de dynamique moléculaire