Laboratoire de Chemoinformatique et proteochemometrique - Unité de bioinformatique structurale
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Identité
Laboratoire de Chemoinformatique et proteochemometrique - Unité de bioinformatique structurale ( CnP-Pasteur )
Institut Pasteur - 28 Rue du Dr Roux, 75015 Paris, France
Contact n°1: Dr Olivier Sperandio
Contact n°2:
Tutelles : Institut Pasteur - CNRS UMR3528
Date de création : 2016
Démarche qualité : En cours
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Nature des prestations
Savoir faire :
Utilisation de la chemoinformatique et de la bioinformatique structurale pour faciliter l'identification de nouvelles cibles thérapeutiques et de sondes chimiques pour leur modulation.
Spécificités :
Application au domaine des interactions protéine-protéine (PPI).
Domaine d'application :
Cancer, infectiologie, réponse immunitaire.
Tests proposés :
Criblage virtuel, conception de chimiothèques à façon, identification de nouvelles cibles PPI prometteuses par proteochemométrie. Optimisation de molécules touche.
Autres activités :
Méthode d'apprentissage, deep learning, docking,
assessment
Ressources
Équipements :
3 stations de travail de type Précision 7820 (128 Go 2666Mhz DDR4, 2x IntelXeon Silver 4110 - 8 coeurs) au sein de l'équipe + accès au cluster de l'Institut Pasteur : approx: 400 noeuds, 5000 coeurs, gpus: 4x K80 (8 gpus), 4x M40, 8x P100
Ressources humaines : 3 personnes
Technologies :
AutoDock Vina, Knime, R Studio, Python, Jupyter, KarmaDock
