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Base de données cheminformatique en ligne : 

Ces bases de données ne sont pas gérées par ChemBioFrance mais individuellement par chaque plateforme. Certaines peuvent être téléchargées en suivant le lien web. Pour les autres, veuillez suivre le lien web pour obtenir plus d'information et contacter les auteurs.

Database

URL

Description

e-Drug3D

Download at:

http://chemoinfo.ipmc.cnrs.fr/MOLDB/index.html

Structure, métabolites actifs et données PK/PD des médicaments approuvés par la FDA

 

PKIDB

Download at:

http://www.icoa.fr/pkidb/

Inhibiteurs de Kinases en cours de développement clinique

Bioinfo DB

Please contact Didier Rognan. More information at:

http://bioinfo-pharma.u-strasbg.fr/bioinfo/

Molécules drug-like commercialement disponibles

sc-PDB

Please contact Didier Rognan. More information at:

http://bioinfo-pharma.u-strasbg.fr/scPDB/

Sites de liaisons 'droguables' des protéines de la PDB

2P2I

Please contact Philippe Roche. More information at:

https://2p2idb.marseille.inserm.fr/2p2idb-update.php

Données structurales sur les interfaces protéine-protéine et leurs inhibiteurs connus

iPPI-DB

Please contact Olivier Sperandio. More information at:

https://ippidb.pasteur.fr/

Structure et activités de modulateurs d'interaction protéine-protéine

BactPepDB

Please contact Pierre Tufféry. More information at:

http://bactpepdb.rpbs.univ-paris-diderot.fr/

Peptides de génomes de procaryotes


Liste des extraits de la Chimiothèque Nationale :

base_extractothequejuin2018.pdf

Liste des structures des composés de la Chimiothèque Nationale [CN] :

Pour visualiser les structures des composés de la Chimiothèque Nationale Essentielle, cliquer sur le lien suivant : CN.pdf. Pour télécharger toutes les structures de la Chimiothèque Nationale, allez dans la sous Rubrique "Accès aux bases de données (utilisateurs enregistrés).

 Outils cheminformatique en ligne : 

Liste-outils-en-ligne-CBF_fr.pdf

Cytotoxicité de la CNE

La cytotoxicité de la CNE (1040 composés) a été mesurée sur 3 lignées cellulaires humaines, normales et cancéreuses, au CMBA (CEA Grenoble)


Barette C.* and Fauvarque M.O., unpublished results

Criblage pour des Molécules BioActives (CMBA)

Univ. Grenoble Alpes, INSERM, CEA, F-38000 Grenoble, France.

*correspondance: caroline.barette@cea.fr


Plateformes de synthèse affiliées à ChemBioFrance

RecensementPlateformeSynthese-total_20211019.xlsx

Nom du Laboratoire Localisation Nom de la personne à contacter Email Numéro de téléphone Nom de la plateforme Date de création de la plateforme Nom et grade des permanents travaillant sur la plateforme Une évaluation des coûts  a-t-elle été établie? Etes-vous capable de fournir des devis ? Une compétence particulière est-elle proposée par la plateforme en terme de famille chimique (sucres, peptides, hétérocycles, nucléosides, etc.) Quelle quantité de produit la plateforme est-elle capable de fournir? (échelle du mg, g, kg?) Quels types d'analyses peuvent être réalisés pour évaluer la pureté? remarques et commentaires site web
LSPCMIB Toulouse Ballereau ballereau@chimie.ups-tlse.fr 05 61 55 65 11 SPCMIB PICT : 2008
Synthèse : 2019
 Yves Génisson DR
Stéphanie Ballereau CRCN
Tessa Castellan TCS
Oui (tarification validés par la tutelle gestonnaire UT3) Oui Préparation diastéréo- et énantio-sélective de composés chiraux sous forme stéréoisomériquement pur Echelle du mg à quelques g MS (incluant HRMS), HPLC (incluant sur phase chirale), RMN, microanalyse, point de fusion Activité de prestation de synthèse propre du laboratoire aussi proposée au sein de la plateforme PICT https://spcmib.univ-tlse3.fr/synthese-chimique-1
Laboratoire COBRA (UMR6014) Rouen Alexandra Le Foll
Muriel Durandetti
alexandra.lefoll@insa-rouen.fr
muriel.durandetti@univ-rouen.fr
02 35 52 24 33 C2I OrgA 2014 -       1 Maitre de conférence (0,2 ETP)
-       2 Ingénieurs de Recherche Spectrométrie de G4Masse (2 ETP)
-       1 Ingénieur d'étude Spectrométrie de Masse (1 ETP)
-       1 Ingénieur d'étude RMN (1 ETP)
-       1 ingénieur d'études Sciences Séparatives (1 ETP)
-       2 Ingénieurs d'étude Chimistes de Synthèse (2 ETP)
-       1 assistante ingénieur Chimiste Analytique (0,5 ETP)
-       3 techniciens Chimiste Analytique (2,5 ETP)
-       3 techniciens chimistes de Synthèse (2,1 ETP)
-       1 adjointe technique (0,5 ETP)
oui oui hétérocycles
molécules fluorées
sondes fluorescentes
sucres
molécules chirales
» 10 g maxi LC/GC chirale ou non
MS/HRMS
RMN
IR/UV/Fluo
Analyse élementaire
alpha D / DC
C2I Orga membre du carnot I2C
Labélisation Cosmetic Valley
- RMN 500 MHz sonde 6Li unique en France
- RMN 600 MHz solide / liquide
- FT/ICR mobiliteé ionique unique en Europe
- Plateau technique pluridisciplinaire unique en France qui permet de répondre à la plupart des demandes en chimie, de la caractérisation et la quantification à la synthèse de molécules complexes, en passant par l'analyse de traces (métaux, COV, HAP...)  
https://www.lab-cobra.fr/plateforme-c2iorga/
CERMN Caen Dallemagne patrick.dallemagne@unicaen.fr 02 31 56 68 13 CCL 1998 Dallemagne PU
Suzanne IE
contractuels
oui oui toutes séries chimiques gramme RMN, HPLC, Masse, IR http://cermn.unicaen.fr/plateformes/chimie-organique-et-medicinale/
Institut de Chimie et de Biochimie Moléculaires et Supramoléculaires - UMR5246 ICBMS Lyon Arnaud COMTE arnaud.comte@univ-lyon1.fr 04 72 43 14 17 Chimiothèque / Synthèse Chimiothèque : 2001, Synthèse : 2016 Arnaud Comte, IE CNRS oui oui (sous 1-5 jours) principalement : chimie hétérocyclique et médicinale, catalyse organométallique (mais autres possibles en collaboration avec les équipes de l'ICBMS) du mg à plusieurs centaines de g (selon la chimie mise en jeu) toute analyse courante en synthèse organique (RMN, GC ou LCMS, IR, UV...) et autres demandes particulières en prestation interne (DRX, GPC, analyse élémentaire, ICP...) www.icbms.fr/chimiotheque/synthese
L2CM Nancy Sandrine ADACH sandrine.adach@univ-lorraine.fr 03 72 74 52 25 SynBioN 2012 SandrineADACH IE
Tioga GULON TC
Fabien LACHAUD IE
oui Oui sucres complexes, hétérocycles,
précurseurs de polymères,
complexes de métaux de transition
du mg à 100 g selon la synthèse RMN proton et carbone
MS : IE, ESI
Analyse élémentaire
http://www.l2cm.univ-lorraine.fr/l2cm/synthese/
Département de Chimie Moléculaire - équipe Synthèse et Réactivité en Chimie Organique (SeRCO) Grenoble JF Poisson jean-francois.poisson@univ-grenoble-alpes .fr,
ou pour une demande de travaux: pso-dcm@univ-grenoble-alpes.fr
04 76 63 59 86
 04 76 63 54 43
Plateau Synthèse Organique (PSO) 2010 M Curtil (IE, reps technique du plateau), PY Chavant (CR), M Fayolle (Tech), PM Léo (Tech), P Cividino (AI), B Bessières (MCF), JF Poisson (Pr) Oui Oui Synthèse de tout type de molécules organiques du miligrame à la 100aine de gramme Toute (RMN, Masse, RX, Analyse élémentraire, Masse exacte, IR, Pouvoir rotatoire, HPLC) Nous travaillons depuis maintenant 10 ans sur la synthèse de molécules organiques soit pour des chercheurs du public (de notre unité de recherche en majorité) ou pour des entreprises privées https://dcm.univ-grenoble-alpes.fr/node/7/plateaux-chimie/synthese-organique
ICCF UMR 6296 UCA/Sigma/CNRS Clermont-Ferrand Sophie FAURE et Florence CHARNAY-POUGET   sophie.faure@uca.fr Florence.CHARNAY_POUGET@uca.fr 04 73 40 52 25  Pôle Synthèse de la Chimiothèque ICCF (Service bio-organique) 2020 Florence Charnay-Pouget (IE CNRS, 0,5 ETP) / Aurélie Job (T UCA, 0,1 ETP) / Sophie Faure (CRCN, 0,1 ETP) non oui Peptidomimétiques, Hétérocycles, Composés fluorés, Phosphonates Méthodologie, Synthèse asymétrique, Synthèse totale Quelques mg à plusieurs dizaines de grammes HPLC, RMN, GC, LC-MS, HRMS,  polarimétrie Création du pôle Synthèse de notre chimiothèque en cours suite au recrutement d'une IE dans le cadre d'une mobilité FSEP. https://iccf.uca.fr/services/bio-organique/chimiotheque/
ICOA UMR7311 Orléans Pascal Bouyssou pascal.bouyssou@univ-orleans.fr 02 38 49 45 84 Plateforme de synthèse 2016 Pascal Bouyssou, MCF, 20%
Sophie Front, Ingénieur, 100%
Oui Oui Synthèse de produits de départ courants (Hétérocycles insaturés, azotés, fluoré, chimie des sucres, des iminosucres)
Répétition de synthèses pour vérification des conditions, optimisation
Resynthèse et purification d'un produit d'intérêt pour tests biologiques
Synthèse de nouveaux exemples de molécules par des voies connues pour renforcer un brevet durant l'année de priorité
Séparation et purifications de produits à l'échelle semi-prép. pour tests biologiques
Synthèse de produits de référence
du mg à 100 g HRMS, LC/MS, RMN, Optique  16 projets achevés à ce jour. https://www.icoa.fr/fr/content/plateforme-de-synth%C3%A8se
Chemistry and Modeling for the Bology of CancerOrsay
UMR9187-U1196, Institut Curie
Orsay Florence Mahuteau
Claire Beauvineau
florence.mahuteau@curie.u-psud.fr
claire.beauvineau@curie.fr
01 69 86 71 59   Claire Beauvineau, IR1 CNRS
Delphine Martin, AI CNRS
pas de ressource synthèse dispo pour des projets extérieurs https://science.curie.fr/plateformes/chimiotheque/
ScanMAT UMS 2001 CNRS rennes Jean-Pierre BAZUREAU Prof jean-pierre.bazureau@univ-rennes1.fr 02 23 23 66  03 S2 Wave platform Création plateforme en janvier 2015 en même temps que l'UMS 1) Jean-Pierre BAZUREAU Professeur       
 2) Ludovic PAQUIN   MCU HDR       
3) Fabienne GAUFFRE         DR CNRS        
 4) Emmanuelle LIMANTON      AI CNRS
OUI, tarification contrôlée et approuvée par le CA d'UR1 chaque année pour tarification de base OUI avec coûts complets ou partiels si necéssaire (*) Hétérocycles (**) mg: pas de problèmes        
g: (1 à 100 g) également mais cela dépendra de la complexicité du schéma de synthèse                           
  
Kg: possible exceptionnellement
1) Analyses élémentaires CHN
2) HRMS  auprès CRMPO de l'UMS ScanMAT en interne de la nôtre: HPLC
(*) Devis établis par fichier Excel fourni par la Satt Ouest Valorisation pour S2 Wave de l'UMS ScanMAT                (**) notre équipe à ISCR a 2 brevets en MedChem dont 1 en licence d'exploitation depuis 2006 pour CNS, l'autre concerne le cancer https://scanmat.univ-rennes1.fr/la-plate-forme-s2wave
LIT Illkirch Didier Rognan pwagner@unistra.fr 03.68.85.42.35 PSO 2016 Patrick Wagner (IE, 100%, responsable)
Jacques Bricard (IE, 100%)
Camille Van Wesemael (AI, 100%)
non pas encore synthèse hétérocyclique
synthèse peptidique (micro-ondes)
20 mg-10g 1H-NMR, 13C-NMR, L-MS, HR-MS plateforme actuellement utilisée à 100% pour des projets internes allant de 1 à 3 mois (21 achevés, 6 en cours)
Affectation possible d'un FTE à temps partiel dès Jan2021
http://medchem.unistra.fr/plateforme-de-synthese-organique-pso/
Laboratoire CEISAM - UMR CNRS 6230 Nantes Arnaud Tessier arnaud.tessier@univ-nantes.fr 02 76 64 50 21 CHEM-Symbiose 2013 Matthieu Rivière (IE Univ. Nantes) 1 ETP
Arnaud Tessier (CR-CN CNRS) 0,5 ETP
Monique Mathé-Allainmat (CR-CE CNRS) 0,2 ETP
Jacques Lebreton (PU-Univ Nantes) 0,1 ETP
Didier Dubreuil (PU-Univ Nantes) 0,1 ETP
en partie
(selon complexité de la molécule)
oui
(gestion CNRS)
La plateforme traite l'ensemble des familles de molécules quelles qu'elles soient.
(Peptide jusqu'à 3 unités)
Savoir-faire également dans la synthèse de molécule marquée (D, C13, N15, O18)
jusqu'à 10g (selon complexité de la molécule) RMN / GC-MS / LC-MS / Pouvoir rotatoire/ Analyse élémentaire / Point fusion  La plateforme est labellisée IBISA et Biogenouest et est ouverte à la prestation et à la collaboration de recherche pour des acteurs du monde académique (CNRS, INSERM, INRAe, ...) https://pf-chemsymbiose.univ-nantes.fr/
Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille (CRCM) Marseille Combes Sébastien sebastien.combes@univ-amu.fr 06 15 51 26 90 DOSynth 2017 Dr Combes Sébastien (MCU, HC), Dr Brémond Paul (MCU, CN) oui oui hétérocycles, oligonucléotides mg au gr RMN, UV, HPLC, MS, HRMS, Microanalyse https://www.crcm-marseille.fr/equipes/equipes-de-recherche/yves-collette-et-xavier-morelli/